A área de Microbiologia de Alimentos engloba estudos relativos aos micro-organismos importantes para garantia da inocuidade dos alimentos, bem como sua vida útil, processamento de produtos tradicionais e desenvolvimento de novos produtos alimentícios, com atributos sensoriais adequados a diferentes públicos consumidores. Destaca-se ainda o desenvolvimento de produtos com alegações funcionais e de promoção da saúde, como os probióticos e prebióticos.

A formação do Microbiologista de Alimentos pode iniciar-se em cursos técnicos de nível médio (por exemplo, Nutrição, Patologia, Química, entre outros) ou mais comumente, na graduação, em cursos da área de alimentos e tecnologia (Engenharia de Alimentos, Ciência dos Alimentos, Biotecnologia, química), de saúde ou biológicas (Farmácia, Biomedicina, Ciências Biológicas, Nutrição, Medicina Veterinária e Zootecnia, entre outros).

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