ANÁLISE COMPARATIVA POR MICROARRANJO DA EXPRESSÃO GENÔMICA DE UMA LINHAGEM APEC

Fernanda Laroza Paganelli (UNICAMP); Wanderley Dias da Silveira (UNICAMP)

O Brasil, atualmente, é o maior exportador mundial de carne de frango, com exportações anuais de US$ 4,2 bilhões. Este cenário demonstra a importância que a indústria avícola representa para as economias interna e exportadora brasileiras, gerando empregos, alimentos de alto valor protéico com relativo baixo custo e divisas. A indústria avícola apresenta fatores que podem afetar significativamente os seus rendimentos, causar diminuição da produtividade e, por conseguinte, aumento de custo. Entre esses fatores, destacam-se infecções causadas por microrganismos patogênicos e, principalmente, por diferentes grupos da bactéria Escherichia coli, agentes significativos de morbidade e mortalidade. As Escherichia coli patogênicas para aves (APECs) estão associadas a diversas doenças em aves de corte, como septicemia, síndrome da cabeça inchada, onfalite e celulite, entre outras. Comparações entre seqüências de genes associados à virulência de uma grande coleção de Escherichia coli extra-intestinal patogênica para humanos e de APECs confirmam uma considerável sobreposição genética, demonstrando a semelhança patogênica entre as linhagens. No presente estudo, uma linhagem APEC causadora de septicemia foi genotipicamente caracterizada, por meio de Microarranjo utilizando-se o "chip Affymetrix Gene E. coli Genome 2.0 array", em duas condições de cultivo (meios de cultura LB e DMEM  a 37°C). Como padrão para comparação utilizou-se uma linhagem de Escherichia coli enterohemorragica (EHEC 8624). Para esta finalidade, nestas condições de cultivo, RNA total foi extraído, o cDNA foi sintetisado e marcado e, em seguida, hibridizado ao "chip". O resultado do escaneamento da hibridização foi determinado utilizando-se GCOS v 1.4, de acordo com as instruções do fabricante. Os dados de cada linhagem foram comparados utilizando-se o programa "GeneChip microarray analyzes" e classificados de acordo com o banco de dados "Clusters of Orthologous Groups (COG)". A partir da comparação das duas condições de cultivo da linhagem septicêmica com a EHEC 8624 observou-se que ambas as linhagens possuem  muitos genes em comum, com a expressão desses genes ocorrendo de maneira diferente nos dois meios de cultura analisados, dependendo do meio de cultura utilizado.