| Congresso Brasileiro de Microbiologia 2023 | Resumo: 1483-1 | ||||
Resumo:A pneumonia adquirida na comunidade está entre as principais causas de morte e hospitalização no Brasil, podendo ser provocada por bactérias atípicas como a Legionella pneumophila (Lp), um bacilo gram-negativo, oportunista e intracelular que vive em ambientes aquáticos naturais e artificiais. A inalação de aerossóis e gotículas contaminadas por Legionella spp. pode ocasionar desde um resfriado, denominado Febre Pontiac, até uma pneumonia que pode ser fatal, conhecida como Doença dos Legionários (DL). O monitoramento da qualidade da água é a principal forma de prevenir a DL, porém, embora existam algumas portarias sobre a qualidade da água no Brasil, água potável não significa água isenta de Legionella spp. Uma vez que a contaminação de sistemas de abastecimento já foi confirmada, este trabalho teve como objetivo realizar o sequenciamento genômico de isolados de Legionella spp. provenientes de fontes artificiais brasileiras. As amostras foram coletadas em hotéis, laboratório e shoppings de oito estados (MG, RS, BA, SP, RJ, PR, SE e PE) nos anos de 2015, 2018 e 2019. Assim, 17 cepas isoladas em meio BCYE–GVPC a partir de amostras de água de torneiras, bebedouro, chuveiros e torres de resfriamento foram submetidas ao WGS (Illumina - 2x150 pb paired-end). O controle de qualidade das reads foi realizado pelo FastQC v.0.11.9, e a trimagem (trimming) com o programa Trimmomatic v.0.36. A montagem de novo foi realizada pelo Unicycler v.0.4.8 e a qualidade avaliada pelo CheckM v.5.0.2. A anotação foi dada pelo Prokka v.1.14.6 e, por fim, a espécie foi confirmada através do FastANI v.1.32. Utilizando ATCC 33152 (L. pneumophila) como cepa de referência, o tamanho total esperado das sequências é de 3.44561 (Mb) e o conteúdo GC deve ser de aproximadamente 38,3%. Dentre os 17 genomas analisados, 16 pertencem a espécie L. pneumophila e as subespécies Pneumophila (15/17) e Fraseri (1/17). Apenas um isolado apresentou maior similaridade com as espécies L. anisa e L. tucsonensis, porém, a identidade média de nucleotídeos (ANI) calculada foi igual a 88,9% e 89,2% respectivamente. Sendo assim, não pertence a nenhuma das espécies mencionadas, apoiando a hipótese desta cepa se tratar de uma nova espécie do gênero, entretanto, para confirmar é necessário realizar mais análises de bioinformática como a comparação de housekeeping genes, além da análise das características morfológicas e bioquímicas por exemplo. É conhecido que o grau de contaminação por Legionella é mais elevado em sistemas de grandes edifícios devido à extensão de seus sistemas hidráulicos, como é o caso dos hotéis e shoppings. As torres de resfriamento também representam um alto fator de risco para a DL, pois estes equipamentos utilizam água como fluido térmico para a refrigeração de processos industriais ou em sistemas centrais de ar-condicionado, fornecendo não só um ambiente propicio para colonização bacteriana (temperatura entre 30° a 40° C e zonas de estagnação) como também na transmissão da DL pela produção de aerossóis que podem alcançar até 6km de distância. Por fim, as informações obtidas pelo sequenciamento genômico podem auxiliar na vigilância molecular deste patógeno, além de fornecer informações e características de cepas brasileiras pela primeira vez. Palavras-chave: Doença dos Legionários, Genoma, Legionella spp., pneumonia Agência de fomento:Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior – CAPES | |||||