Resumo

As espécies do gênero Acinetobacter são metabolicamente pouco ativas, portanto, fenotipicamente muito semelhantes, dificultando a identificação laboratorial. Recentemente, foi proposta a análise da sequência de fragmentos do gene rpoB e de fragmentos flanqueadores a esse gene para a identificação de 24 genomospécies (gnsp.) diferentes. O presente estudo avaliou a utilização da metodologia proposta na identificação das genomospécies de Acinetobacter isoladas no Hospital Universitário da UFJF. Foram estudadas 57 linhagens isoladas de janeiro de 2006 a setembro de 2007. O DNA total destas linhagens foi submetido à PCR para a amplificação e sequenciamento de fragmentos do gene rpoB, bem como de seus flanqueadores, seguindo um esquema proposto por La Scola e colaboradores (2006). Este esquema consiste na determinação de um fragmento do gene rpoB denominado 'zona 1', capaz de distinguir 20 das 24 gnsp. Como A. junii e A. grimontii , assim como A. baylyi e gnsp 11, são indistinguíveis pela análise da zona 1, é necessária a determinação de outro fragmento. No primeiro caso, o fragmento do gene rpoB denominado 'zona 2' e, no segundo caso, o fragmento espaçador entre o gene rpoB e rpoC. Pela comparação da zona 1 das 57 linhagens estudadas, 54 foram similares à zona 1 de A. baumannii (98,5 a 100% de identidade). Esse resultado confirma a grande maioria das linhagens serem da espécie A. baumannii. A sequência da zona 1 de uma linhagem foi similar (99%) a de A. gnsp. 13TU, a sequência de outra linhagem foi similar (99%) a de A. gnsp. 3 e a sequência de uma terceira linhagem foi similar a de A. baylyi (98%) e gnsp. 11 (99%). A sequência do espaçador rpoB-rpoC foi determinada na tentativa de distinguir entre essas duas alternativas de identificação. O fragmento obtido foi de 220 pb, superior ao esperado para as duas alternativas, e com porcentagens de identidade muito baixas com as sequências de A. baylyi e gnsp. 11 (76% e 85%, respectivamente). Portanto, para as amostras desse estudo, o esquema de identificação utilizado se mostrou efetivo para todas as linhagens, com exceção de uma. A utilização de sequências intergênicas não parece ser muito confiável devido à grande variabilidade que essas podem apresentar. Para a correta identificação de A. baylyi e gnsp. 11, talvez seja necessária a determinação de genes housekeeping como gyrB ou recA. Instituição de fomento: FAPESP.